Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики інфекційних хвороб
Відділення організації епідеміологічних досліджень
Відділення антимікробної резистентності та інфекційного контролю
Відділення особливо небезпечних інфекцій
Відділення дезінфектології
Відділ імунопрофілактики
Склад імунобіологічних препаратів та лікарських засобів
Бактеріологічна лабораторія
Вірусологічна лабораторія
Лабораторія особливо небезпечних інфекцій
Паразитологічна лабораторія
Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики неінфекційних захворювань
Лабораторія електромагнітних полів та інших фізичних факторів
Санітарно-гігієнічна лабораторія
Токсикологічна лабораторія
Відділ моніторингу, комунікації та реагування на небезпеки
Відділ санітарно-епідеміологічного нагляду на видах транспорту
завідувач відділу
Черняєв Сергій Анатолійович
Відділення організації епідеміологічних досліджень
завідувач відділення
Комісарчик Тетяна Борисівна
Відділення організації санітарно-гігієнічних досліджень
завідувач відділення
Пономаренко Вікторія Вікторівна
Санітарно-карантинне відділення
завідувач відділення
Коваль Вадим Васильович
Відділ комунікації та інформаційно-роз’яснювальної роботи
Відділ організаційного забезпечення та документообігу
Відділ правового забезпечення
Фінансово-економічний відділ
Відділ бухгалтерського обліку та звітності
Відділ кадрового забезпечення
Господарський відділ